Smatra se da shizofrenija ima do 70-80% genetske naslednosti. Poput bipolarnog poremećaja, stepen prvog stepena u odnosu na poremećaj drastično povećava rizik od razvoja shicofrenije kasnije u životu – iako su faktori okoline takođe izuzetno važni. Međutim, teško je odvojiti da li je to zbog genetskih uzroka ili zajedničkih uslova okoline. Kumulativni efekat više naslednih ili de novo mutacija / polimorfizama u kombinaciji sa okidačima iz okruženja može povećati rizik od razvoja shicofrenije.

Na primer, varijante broja kopija (CNV) uključene u DiGeorgeov sindrom (22k11.2) koje uključuju brisanje oko 50 gena, uključujući COMT i 17k12 sindrom mikrodelecije, visoko su povezane sa povećanim rizikom od razvoja shicofrenije – ali su takođe pretežno povezane komorbidno sa ASD i drugim intelektualnim poteškoćama. Druge specifične genetske mutacije umešane u shicofreniju uključuju genetske poremećaje u LAMA2, SETD1A, DPID, TRRAP, TAF13, ARC i VPS39.

Možda najpoznatiji genetski uzrok shicofrenije je DISC1 (poremećen u shicofreniji 1), identifikovan u jednoj škotskoj porodici koja je imala shicofreniju, a zatim i u drugim porodicama, uključujući Ameriku. Međutim, kasnije GVAS studije nisu pokazale jaku povezanost između DISC1 i shicofrenije, često sa mešovitim rezultatima. Iako DISC1 možda nije često umešan gen u GVAS studijama, ipak pokazuje specifične efekte nivoa mutacije u određenim porodicama sa shicofrenijom, na primer, 1k43: 11k14